探索 科研文献基本常识和替代度量
DOI
DOI 是数字对象标识符(Digital Object Identifier)的缩写。它是一种用于唯一标识并定位数字文献的数字编码系统。DOI由一个前缀和一个后缀组成,前缀通常是由出版商或DOI注册机构分配的,后缀由出版者自行分配。通过DOI,读者可以方便地找到和引用特定的学术论文,而不用担心文献的网址会发生变化或失效。
DOI的作用类似于图书的ISBN号码,但与ISBN号码不同的是,DOI不仅适用于图书,还适用于期刊文章、会议论文、报告、数据集等各种类型的数字文献。许多学术期刊和数据库都要求作者在发表论文时提供DOI号码,并将其包含在参考文献中。在引用文献时,读者可以使用DOI号码链接到文献的网页或其他文献信息数据库上,以获取文献的全文或相关信息。
除了方便读者查找和引用文献外,DOI还有助于出版商、作者和学术机构跟踪文献的使用情况和影响力,以及评估学术成果的质量和影响力。一些学术数据库和搜索引擎,如PubMed和Google Scholar,也支持使用DOI号码进行文献检索和引用分析。 #viaPoe
编号规则
样例比如 10.48550/arXiv.2302.14233
总之,DOI 号由前缀、注册机构、后缀和解析器组成。前缀和注册机构由国际 DOI 基础设施指定,后缀由注册机构分配,解析器由 DOI 注册机构或其他组织提供。这种标识符的结构使得数字对象可以被唯一地标识,并且可以方便地访问和引用。 #viaPoe
DOI.org
DOI.org https://doi.org 是一个由国际DOI基金会(International DOI Foundation)维护的网站,旨在为用户提供一个方便快捷的途径来查找和访问数字文献的DOI号码。这个网站允许用户在一个地方搜索和访问来自不同出版商和数据库的数字文献,并使用其DOI号码来定位和访问这些文献。
在DOI.org上,用户可以输入文献的标题、作者、关键词或其他相关信息来搜索文献,并获得与该文献相关的DOI号码和其他元数据。用户还可以使用DOI号码来直接访问文献的网页或下载链接,而无需记住文献的网址或进行繁琐的搜索。
除了提供DOI号码的搜索和访问功能外,DOI.org还提供了有关DOI号码和数字文献的详细信息和资源,如DOI号码的格式、DOI注册机构的列表、DOI元数据规范和DOI解析服务等。此外,DOI.org还提供了一些工具和服务,如DOI元数据批量导出、DOI元数据API、DOI解析器和DOI注册机构查询工具等,以帮助出版商、作者和学术机构管理和推广数字文献。 #viaPoe
PNAS
PNAS(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)是美国国家科学院出版的一份同行评审的科学期刊。PNAS的出版范围涵盖生物学、生态学、行为学、物理学、化学、工程学、计算机科学、地球和空间科学等多个领域。PNAS的文章包括研究论文、评论、科学通信和观点等。
PNAS的出版历史可以追溯到1914年。它是美国最古老的科学期刊之一,也是全球最受欢迎的科学期刊之一。PNAS的文章经过同行评审,并由来自美国和其他国家的杰出科学家担任编辑和审稿人。该期刊的目标是在科学界促进重要研究的发现和交流,并为解决全球性问题提供关键见解。
PNAS的网站 https://www.pnas.org/ 提供了免费的文章摘要和一些免费的全文文章,同时也提供了对PNAS的订阅服务。在PNAS的网站上,读者可以搜索和浏览最新的研究成果、阅读专家评论和科学新闻,并了解科学会议和其他相关活动。此外,PNAS还提供了一些有用的工具,例如文章分类、作者搜索、引用检索和社交媒体分享等。总的来说,PNAS是一个重要的科学期刊,为科学家和科学爱好者提供了一个重要的资源和平台。 #viaPoe
PubMed
PubMed是一个由美国国家医学图书馆(National Library of Medicine)所创建和维护的免费数据库,它提供了超过3000万份生物医学文献的索引、摘要和全文。 PubMed的文献来源包括生物医学领域的期刊、图书、标准和会议论文等。
PubMed的文献内容覆盖了生物医学领域的各个方面,包括生理学、药理学、生物化学、医学、护理、牙科学、兽医学和公共卫生等。这使得PubMed成为了医学和生物医学领域的主要信息源之一,许多医学研究人员、医生、护士和学生都经常使用PubMed来获取最新的研究成果和医学知识。
除了提供文献索引和摘要外,PubMed还提供了一些高级搜索工具和筛选选项,使用户可以更加精确地查找所需文献。此外,PubMed还提供了一些其他功能,如文献推荐、文献收藏、文献导出、作者和期刊搜索等。PubMed还与Medline相互关联,Medline是一个由美国国家医学图书馆创建的医学文献数据库。 #viaPoe
PLOS
PLOS(Public Library of Science) https://journals.plos.org/ 是一个非营利性的学术出版机构,旨在通过开放获取的方式促进科学研究成果的分享和传播。PLOS的宗旨是为科学研究人员提供一个开放的平台,让他们能够更加便捷地分享和获取最新的研究成果。
PLOS旗下有七个学术期刊,分别是PLOS Biology、PLOS Medicine、PLOS Computational Biology、PLOS Genetics、PLOS Pathogens、PLOS Neglected Tropical Diseases和PLOS ONE。这些期刊涵盖了生物医学、计算机科学、遗传学、病原学、公共卫生和其他相关领域的研究。
PLOS的期刊都采用开放获取的出版模式,这意味着任何人都可以免费阅读和下载其中的文章。此外,PLOS的出版流程也非常透明和公正,所有提交的文章都要经过同行评审,确保文章的质量和科学性。
除了出版学术期刊外,PLOS还推出了一些其他的服务和项目,如PLOS Blogs、PLOS Collections和PLOS Currents等。其中,PLOS Blogs是一个由科学研究人员和科学写作专家共同维护的博客平台,提供了各种科学话题的讨论和分析;PLOS Collections则是一个收集了PLOS期刊中相关主题文章的集合,方便读者快速获取相关研究成果;而PLOS Currents则是一个在线预印本平台,提供了一种快速分享和传播科学研究成果的方式。 #viaPoe
预印本
以下是几个知名的预印本论文网站:
以上是一些著名的预印本论文网站,它们为科学研究人员提供了一个快速分享和传播研究成果的平台,帮助推动了科学研究的发展。 #viaPoe
scientometrics and bibliometrics 科学计量学和文献计量学
关于更客观的期刊指标,越来越多的人认为,为了提高准确性,必须辅以文章级指标和同行评审。对方法论质量和可靠性的研究发现,“在多个领域发表的研究作品的可靠性可能会随着期刊排名的提高而降低”。
Citation impact - Wikiwand --- 引文影响 - Wikiwand 综述, 写了文章级/作者级的常见指标,
Twimpact
“Twimpact 因子”,论文在发布的前 7 天收到的推文数量,以及一个 Twindex,它是文章 Twimpact 因子的排名百分位数
altmetrics 还采用二级知识来源中的引用。例如,ImpactStory 计算一篇论文被维基百科引用的次数。 Plum Analytics 还为各种学术出版物提供指标,力求跟踪研究生产力。 PLOS 也是一种可用于利用参与信息的工具
altmetrics 的支持者明确表示,许多指标显示的是注意力或参与度,而不是对科学进步的影响质量
F1000
F1000(前身为“Faculty of 1000”)是面向科学家、学者和临床研究人员的开放研究出版商。 F1000 通过在发表研究文章之后而不是之前提供同行评审,提供与标准学术期刊不同的研究评估服务 它发表文章和其他研究内容的“合集”
已经表明,出版物收到的引用次数,一旦根据同一学科和同一年发表的文章的平均值进行适当重新调整,就会遵循普遍的对数正态分布,这在每个学科中都是相同的.这一发现提出了一种通用的引文影响度量,通过适当重新调整引用计数和重新引用出版物来扩展 h 指数,但是计算这种通用度量需要收集每个学科和年份的广泛引文数据和统计数据。已经提出诸如 Scholarometer 之类的社会众包工具来满足这一需求
Altmetric Dimensions 这俩定位类似?
dimensions.ai vs altmetric.com Traffic Comparison | Similarweb -- 这网站有点意思, 类似 https://alternativeto.net/
According to the information I found on the web, altmetric.com and dimensions.ai are two different platforms that provide different types of data and services. #viaBing
altmetric.com is a platform that focuses on tracking and analyzing the dissemination and impact of research outputs on social media, news, blogs, policy and other platforms1. It can help authors and organizations understand what conversations are happening around their research and how they are received by the public and peers. altmetric.com displays the online attention score of research outputs through a colorful badge (Badge), and provides detailed data and analysis1.
dimensions.ai is a platform that provides comprehensive research data and solutions2. It covers 135 million research publications, as well as related grants, datasets, clinical trials, patents and policy documents2. It can help users discover, analyze and evaluate research activities and outputs. dimensions.ai also displays the citation situation of research outputs through a colorful badge (Badge), including indicators such as total citations, recent citations, field citation ratio (FCR), relative citation ratio (RCR) and so on1.
In short, altmetric.com and dimensions.ai have their own characteristics, and they can measure and show the value and impact of research outputs from different angles and dimensions.
如何查询论文被其他哪些文献引用过? - 知乎
SCI数据库中查找,即Web of Science
做为论文价值衡量的引文网络, 现有的期刊怎么做的?
Nature
small teams 作者给的全文 on nature
可以查引别人和被引
无完整权限时 Large teams develop and small teams disrupt science and technology 不能访问全文时也一样, 可以查引别人, 看到了 "This article is cited by"!
直接列出了 Altmetric 分数
PubMed
Gene expression analysis in clear cell renal cell carcinoma using gene set enrichment analysis for biostatistical management - PubMed
有Cited by See all "Cited by" articles, 但是ref在哪? 可能只能看论文原文
似乎没啥额外对的元数据
PNAS
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.1516179112
有 ref 和 cited by
有个超小按钮可以展开侧栏 Metrics & Citations
检查这些网站的特点, 是否有跟引文网络相关的改良
是否支持预印本
对于各种预印本支持怎么样? https://www.medrxiv.org/ https://www.biorxiv.org/
Elicit https://elicit.org/ 使用语言模型来帮助您自动化研究工作流程,例如文献综述的某些部分。Elicit 可以在没有完美关键字匹配的情况下找到相关论文,总结论文中针对您的问题的要点,并从论文中提取关键信息。虽然回答问题是 Elicit 的主要重点,但它还有其他功能有助于头脑风暴,总结和文本分类。
免费, 侧重论文快速阅读理解
问问题, 会高亮原文中句子, 怎么做到的? #check/ai/attention
预设了一些对论文可靠性的提问, 例如:
Can I trust this paper?
• This study was experimental
• No mention found of funding source
• No mention found of participant count
• No mention found of multiple comparisons
• No mention found of intent to treat
• No mention found of preregistration
(1)通过提出问题引出文献(可以处理自然语言)
(2)可以直接找到引用者所写的内容
(3)可以提炼出文章的方法、技术、创新点等缺点:
(1)主要优化体现在对医学等领域,不是适合所有专业的工具
(2)数据库主要基于 Semantic scholar,比较新的文献数据库里的数据不多 ref
可以直接展示 cited by 和 ref
对于每个引用, 可以分析出来该引用段落的含义是 supporting / mentioning / contrasting
慢, 左侧栏经常加载不出来
如果有感兴趣的论文,想进一步看下它周围的引用关系,还可以尝试 Connected Papers。比如我把一篇多模态应用到自动驾驶领域的文章输入进去,就能得到一张引用关系图
带多层的关系网, 适合挖掘一个主题? 适合找核心论文?
限制: You’ve used 2/2 free graphs this month. Log in to get 3 more.
这也太少了吧
只是一个基于 Semantic Scholar 的可视化平台
较详细的介绍 写的挺全, 搜索和页面展示的细节都有截图
官方的 web API 文档 Semantic Scholar - Academic Graph API
第三方的Python包装 danielnsilva/semanticscholar: Unofficial Semantic Scholar Academic Graph API client library for Python
看着靠谱, 有 cited ref related 条目列举展示很方便
论文领域? 似乎很全
cited by 会给你列出
(1)关键词检索,AI 智能推荐
(2)对引用文献,参考文献和推荐相关文献
(3)对引用文献和参考文献可以进行多种方式排序有利于文献分析
(4)有阅读器功能可以智能解释文章(但只支持 ArXiv 上的文章,多为数学、物理学相关文章)缺点:结果完全由文本展示,没有更直观的可视化展示 ref
拿 doi 啥也查不到, 先观望, 只能查 Plos ONE 吗?
#### 待测试
查看引用论文与相关论文
Galactica https://galactica.org 模型在一个大型语料库上进行训练,该语料库包含超过3.6亿个上下文引用和超过5000万个独特的参考文献,这些参考文献在不同的来源中进行了规范化。提供引用出处并帮助发现相关论文。提供论文的总结与下载链接 Paper Brain
https://www.paperbrain.study
没看明白, 需要自己上传?提供最新的论文并为其做总结
https://www.scholarcy.com/上传论文并对其提问
https://typeset.io
-- #byProbe
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